Difference between revisions of "FODOMUST"
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Pour tout renseignement sur les méthodes liées à Mustic et JCL et pour obtenir les sources [mailto:Pierre.Gancarski@unistra.fr Cliquez ici] | Pour tout renseignement sur les méthodes liées à Mustic et JCL et pour obtenir les sources [mailto:Pierre.Gancarski@unistra.fr Cliquez ici] | ||
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La plate-forme bioinformatique de Strasbourg BISTRO a été reconnue par l’Institut Français de Bioinformatique comme membre du réseau national des plateformes bioinformatiques (RéNaBi) Nord-Est qui inclut, outre Strasbourg, Lille, Vandoeuvre les Nancy et Reims en accord avec la politique de l’IFB et de RéNaBi d’améliorer la visibilité nationale et internationale des réalisations bioinformatiques françaises en aggrégeant des plateformes de sites multidisciplinaires et multi-instituts. Dans ce cadre, BISTRO réunit sur Strasbourg des équipes IGBMC, IBMC, IBMP, GMGM, IPHC, ICube et est à même de fournir un ensemble bioinformatique cohérent incluant : expertise, outils et ressources, algorithmes d'exploration de données. Ces ressources sont axées sur les analyses évolutives et fonctionnelles dans divers domaines d'application, y compris les études biomédicales, les plantes, les levures et bactéries. | La plate-forme bioinformatique de Strasbourg BISTRO a été reconnue par l’Institut Français de Bioinformatique comme membre du réseau national des plateformes bioinformatiques (RéNaBi) Nord-Est qui inclut, outre Strasbourg, Lille, Vandoeuvre les Nancy et Reims en accord avec la politique de l’IFB et de RéNaBi d’améliorer la visibilité nationale et internationale des réalisations bioinformatiques françaises en aggrégeant des plateformes de sites multidisciplinaires et multi-instituts. Dans ce cadre, BISTRO réunit sur Strasbourg des équipes IGBMC, IBMC, IBMP, GMGM, IPHC, ICube et est à même de fournir un ensemble bioinformatique cohérent incluant : expertise, outils et ressources, algorithmes d'exploration de données. Ces ressources sont axées sur les analyses évolutives et fonctionnelles dans divers domaines d'application, y compris les études biomédicales, les plantes, les levures et bactéries. | ||
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Latest revision as of 11:39, 16 November 2023
FoDoMuST: Fouille de données Multi-Stratégie Multi-Temporelles
Présentation
La plateforme FODOMUST est une implantation concrète des méthodes, librairies et interfaces dédiées au clustering de données complexes proposées au sein d’ICube.
Elle intègre une version multisource de la méthode de clustering collaboratif multistratégie SAMARAH. Sa principale originalité est qu’elle offre à l’utilisateur les méthodes et les interfaces permettant le clustering sous contraintes incrémental de données temporelles symboliques ou numériques. Article de présentation
MultiCube : Une interface pour le clustering sous contraintes incrémental de séries temporelles d'images
MultICube (Multi-Strategy Multi-Resolution Multi-Temporal Image Classification) est une interface permettant la classification d'images de télédétection par des approches pixels et orientées objets.
Elle permet de :
- charger/modifier/sauvegarder des images via Orfeo Tool Box (CNES),
- classifier (clustering uniquement) des images (par pixels ou basée régions) via la bibliothèque JCL,
- segmenter de telles images via la bibliothèque JSL.
- d'imposer des contraintes lors du clustering
Deux bibliothèques
- Java Clustering Library : regroupe un ensemble des classifieurs classiques (Kmeans, Cobweb, …) et la méthode de classification collaborative multi-stratégie SAMARAH
- Java Segmentation Library : regroupe tous les algorithmes de segmentation proposés par l'équipe. Elle permet aussi d'utiliser une part importante de algorithmes intégrés dans l'OTB. L’interface MULTICUBE dédiée à l’analyse de séries temporelles offre aussi un accès à un ensemble d’algorithmes de segmentation soit propres à ICUBE soit faisant appel à l’OTB diffusée par le CNES.
Téléchargement et exécution de FoDoMuST-MultICube
Vous pouvez télécharger le client avec le lien ci-dessous. Pour pouvoir l'exécuter il faudra avoir au préalable téléchargé Java 11 JRE (ou JDK) ici. Attention, cette version n'est qu'un client léger et nécessite d'être connecté à un serveur.
Un tel serveur est ouvert à tous (sur une machine hébergée à l'Unistra) et est configuré comme serveur par défaut. Si vous rencontrez des problèmes veuillez nous contacter directement.
Attention : To analyze the generated kmz file, we have to use Google Earth Pro. This version of Google Earth doesn't run in browsers and we have to install it on our computer. Here is the link to download it:
https://www.google.com/intl/fr_ALL/earth/about/versions/
Pour le code vous pouvez vous referrer à notre Git : https://forge.icube.unistra.fr/sdc-fodomust-dev-group/fodomust
Contacts
Pour tout renseignement sur les méthodes liées à Mustic et JCL et pour obtenir les sources Cliquez ici